Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB1P11230 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNB1P11230 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB1P11230 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNB1P11230 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNB1P11230 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms