Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRM1P11229 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM1P11229 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRM1P11229 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRM1P11229 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRM1P11229 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms