Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA8P0DM63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA8P0DM63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA8P0DM63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA8P0DM63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA8P0DM63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPA8P0DM63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA8P0DM63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA8P0DM63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA8P0DM63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms