Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 HIS2YFR025C 1008 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 YMR265CYMR265C 1386 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 SWT21YNL187W 1074 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 SLG1YOR008C 1137 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 HAP5YOR358W 729 nt7.32□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 YJL045WYJL045W 1905 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 YCR025CYCR025C 411 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 TPC1YGR096W 945 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 FLX1YIL134W 936 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 CWP2YKL096W-A 279 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 SPE2YOL052C 1191 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 ITR2YOL103W 1830 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 YMR209CYMR209C 1374 nt7.31□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 GID8YMR135C 1368 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 GUT1YHL032C 2130 nt7.3□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 RPD3YNL330C 1302 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 ELO1YJL196C 933 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 CYC3YAL039C 810 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 ZAP1YJL056C 2643 nt7.29□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 YHR219WYHR219W 1875 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 HXT10YFL011W 1641 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 STF1YDL130W-A 261 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 SUV3YPL029W 2214 nt7.28□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 LPD1YFL018C 1500 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 PHB2YGR231C 933 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 YIA6YIL006W 1122 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 YKL133CYKL133C 1392 nt7.27□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 NAM8YHR086W 1572 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SRP102YKL154W 735 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 RIB1YBL033C 1038 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 ADH3YMR083W 1128 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 YPT11YNL304W 1254 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SNX3YOR357C 489 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 ENO1YGR254W 1314 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SDS24YBR214W 1584 nt7.25□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 MET1YKR069W 1782 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 MOB1YIL106W 945 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 YKR012CYKR012C 378 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 REX2YLR059C 810 nt7.24□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 MRS6YOR370C 1812 nt7.23□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 ECM27YJR106W 2178 nt7.23□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 UGP1YKL035W 1500 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SER2YGR208W 930 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SRP54YPR088C 1626 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 SAM50YNL026W 1455 nt7.22□□□□□ -1.25
RPL35BP0CX85 HTS1YPR033C 1641 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 LYS20YDL182W 1287 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 LSR1LSR1 1175 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 RCR1YBR005W 642 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 CRC1YOR100C 984 nt7.21□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 SWM1YDR260C 513 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 YMR007WYMR007W 381 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 VBA3YCL069W 1377 nt7.2□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 SAN1YDR143C 1833 nt7.18□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 PSD1YNL169C 1503 nt7.18□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 RPC31YNL151C 756 nt7.18□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 SBP1YHL034C 885 nt7.17□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 YKL053WYKL053W 375 nt7.17□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 SOD2YHR008C 702 nt7.15□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 RSM7YJR113C 744 nt7.15□□□□□ -1.26
RPL35BP0CX85 YFR020WYFR020W 699 nt7.14□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 YLR280CYLR280C 351 nt7.14□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 CYT1YOR065W 930 nt7.14□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 ODC1YPL134C 933 nt7.14□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 CCR4YAL021C 2514 nt7.13□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 ERO1YML130C 1692 nt7.13□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 GAS1YMR307W 1680 nt7.13□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 KGD2YDR148C 1392 nt7.13□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 RIM2YBR192W 1134 nt7.13□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 MDM35YKL053C-A 261 nt7.12□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 YGR210CYGR210C 1236 nt7.11□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 YOR072WYOR072W 315 nt7.1□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 YHR131CYHR131C 2553 nt7.1□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 PTC6YCR079W 1329 nt7.09□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 ERG6YML008C 1152 nt7.09□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 NDE1YMR145C 1683 nt7.09□□□□□ -1.27
RPL35BP0CX85 GGA2YHR108W 1758 nt7.08□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 YLR460CYLR460C 1131 nt7.08□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 YPL108WYPL108W 507 nt7.08□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 DPL1YDR294C 1770 nt7.08□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 POP2YNR052C 1302 nt7.07□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.06□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 DMA2YNL116W 1569 nt7.05□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 INH1YDL181W 258 nt7.05□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 YIR035CYIR035C 765 nt7.05□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 YMR166CYMR166C 1107 nt7.05□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 PMA2YPL036W 2844 nt7.04□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 UFD1YGR048W 1086 nt7.03□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 CHS7YHR142W 951 nt7.03□□□□□ -1.28
RPL35BP0CX85 RRT14YIL127C 621 nt7.02□□□□□ -1.29
RPL35BP0CX85 GPM1YKL152C 744 nt7.02□□□□□ -1.29
RPL35BP0CX85 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.01□□□□□ -1.29
RPL35BP0CX85 THI3YDL080C 1830 nt7□□□□□ -1.29
RPL35BP0CX85 TGA1tA(UGC)A 73 nt7□□□□□ -1.29
RPL35BP0CX85 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7□□□□□ -1.29
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