Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT19P08727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT19P08727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT19P08727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT19P08727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT19P08727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT19P08727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT19P08727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT19P08727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT19P08727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT19P08727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT19P08727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT19P08727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT19P08727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT19P08727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT19P08727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT19P08727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT19P08727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT19P08727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT19P08727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT19P08727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT19P08727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT19P08727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT19P08727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT19P08727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT19P08727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT19P08727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT19P08727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT19P08727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT19P08727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT19P08727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT19P08727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT19P08727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT19P08727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT19P08727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT19P08727 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT19P08727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT19P08727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT19P08727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT19P08727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT19P08727 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT19P08727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT19P08727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT19P08727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT19P08727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT19P08727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT19P08727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT19P08727 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT19P08727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT19P08727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT19P08727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT19P08727 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT19P08727 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT19P08727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT19P08727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT19P08727 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT19P08727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT19P08727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT19P08727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT19P08727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT19P08727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT19P08727 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT19P08727 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT19P08727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT19P08727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT19P08727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT19P08727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT19P08727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT19P08727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT19P08727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT19P08727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT19P08727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT19P08727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT19P08727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT19P08727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT19P08727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT19P08727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms