Protein–RNA interactions for Protein: P07477

PRSS1, Trypsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS1P07477 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRSS1P07477 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRSS1P07477 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRSS1P07477 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRSS1P07477 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms