Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA4P06727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA4P06727 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA4P06727 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA4P06727 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA4P06727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA4P06727 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOA4P06727 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOA4P06727 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA4P06727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA4P06727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA4P06727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA4P06727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA4P06727 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA4P06727 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA4P06727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA4P06727 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA4P06727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA4P06727 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA4P06727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA4P06727 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA4P06727 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA4P06727 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA4P06727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA4P06727 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA4P06727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA4P06727 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA4P06727 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA4P06727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA4P06727 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA4P06727 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA4P06727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA4P06727 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA4P06727 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA4P06727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA4P06727 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA4P06727 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA4P06727 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA4P06727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA4P06727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA4P06727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA4P06727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA4P06727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA4P06727 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA4P06727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA4P06727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA4P06727 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA4P06727 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA4P06727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA4P06727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA4P06727 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA4P06727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA4P06727 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA4P06727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA4P06727 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA4P06727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA4P06727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA4P06727 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA4P06727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA4P06727 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA4P06727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA4P06727 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOA4P06727 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA4P06727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA4P06727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA4P06727 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA4P06727 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA4P06727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA4P06727 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA4P06727 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APOA4P06727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA4P06727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA4P06727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA4P06727 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA4P06727 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms