Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG5P05408 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG5P05408 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG5P05408 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG5P05408 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG5P05408 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG5P05408 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG5P05408 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG5P05408 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG5P05408 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG5P05408 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG5P05408 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG5P05408 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG5P05408 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG5P05408 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG5P05408 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG5P05408 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG5P05408 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG5P05408 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG5P05408 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG5P05408 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG5P05408 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG5P05408 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG5P05408 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG5P05408 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG5P05408 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG5P05408 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG5P05408 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG5P05408 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG5P05408 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG5P05408 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG5P05408 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG5P05408 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG5P05408 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG5P05408 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG5P05408 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG5P05408 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG5P05408 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG5P05408 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG5P05408 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG5P05408 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG5P05408 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG5P05408 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG5P05408 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG5P05408 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG5P05408 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG5P05408 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG5P05408 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCG5P05408 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG5P05408 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG5P05408 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG5P05408 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG5P05408 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCG5P05408 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG5P05408 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG5P05408 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCG5P05408 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG5P05408 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG5P05408 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCG5P05408 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG5P05408 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG5P05408 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG5P05408 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCG5P05408 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCG5P05408 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG5P05408 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCG5P05408 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG5P05408 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG5P05408 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCG5P05408 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG5P05408 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG5P05408 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCG5P05408 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG5P05408 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCG5P05408 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCG5P05408 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms