Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFIP05156 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFIP05156 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFIP05156 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFIP05156 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFIP05156 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFIP05156 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFIP05156 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFIP05156 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFIP05156 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFIP05156 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFIP05156 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFIP05156 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFIP05156 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFIP05156 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFIP05156 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFIP05156 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFIP05156 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFIP05156 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFIP05156 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFIP05156 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CFIP05156 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFIP05156 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFIP05156 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFIP05156 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFIP05156 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFIP05156 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFIP05156 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFIP05156 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFIP05156 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFIP05156 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFIP05156 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFIP05156 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFIP05156 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFIP05156 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFIP05156 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFIP05156 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFIP05156 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFIP05156 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFIP05156 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFIP05156 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFIP05156 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFIP05156 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFIP05156 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFIP05156 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFIP05156 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFIP05156 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFIP05156 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFIP05156 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFIP05156 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFIP05156 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFIP05156 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFIP05156 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFIP05156 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFIP05156 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CFIP05156 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFIP05156 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFIP05156 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFIP05156 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFIP05156 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFIP05156 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFIP05156 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFIP05156 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CFIP05156 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFIP05156 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFIP05156 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFIP05156 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFIP05156 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFIP05156 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFIP05156 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFIP05156 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFIP05156 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFIP05156 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFIP05156 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFIP05156 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFIP05156 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFIP05156 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFIP05156 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFIP05156 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFIP05156 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFIP05156 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFIP05156 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFIP05156 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFIP05156 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFIP05156 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFIP05156 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFIP05156 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFIP05156 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFIP05156 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFIP05156 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFIP05156 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFIP05156 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFIP05156 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFIP05156 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms