Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA1P02647 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA1P02647 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA1P02647 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA1P02647 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA1P02647 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA1P02647 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA1P02647 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA1P02647 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA1P02647 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA1P02647 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA1P02647 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA1P02647 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA1P02647 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA1P02647 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA1P02647 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA1P02647 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA1P02647 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA1P02647 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA1P02647 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA1P02647 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA1P02647 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA1P02647 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA1P02647 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA1P02647 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA1P02647 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA1P02647 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA1P02647 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA1P02647 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA1P02647 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA1P02647 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA1P02647 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA1P02647 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA1P02647 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA1P02647 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA1P02647 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA1P02647 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA1P02647 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA1P02647 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA1P02647 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA1P02647 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA1P02647 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA1P02647 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA1P02647 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA1P02647 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA1P02647 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA1P02647 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA1P02647 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA1P02647 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA1P02647 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA1P02647 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA1P02647 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA1P02647 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA1P02647 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA1P02647 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA1P02647 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA1P02647 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA1P02647 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA1P02647 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA1P02647 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA1P02647 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA1P02647 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA1P02647 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA1P02647 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA1P02647 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA1P02647 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA1P02647 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA1P02647 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA1P02647 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA1P02647 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA1P02647 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA1P02647 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA1P02647 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA1P02647 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA1P02647 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA1P02647 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA1P02647 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA1P02647 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA1P02647 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA1P02647 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA1P02647 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA1P02647 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA1P02647 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA1P02647 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA1P02647 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms