Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-13P01766 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-13P01766 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-13P01766 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-13P01766 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-13P01766 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-13P01766 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-13P01766 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-13P01766 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms