Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFB1P01137 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFB1P01137 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFB1P01137 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFB1P01137 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TGFB1P01137 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TGFB1P01137 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms