Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM16O95361 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM16O95361 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM16O95361 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM16O95361 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM16O95361 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms