Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIF4AO95239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIF4AO95239 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIF4AO95239 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KIF4AO95239 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4AO95239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4AO95239 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms