Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4BO94953 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4BO94953 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4BO94953 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4BO94953 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4BO94953 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms