Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A2O94788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH1A2O94788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALDH1A2O94788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A2O94788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH1A2O94788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms