Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNKO75909 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNKO75909 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNKO75909 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNKO75909 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNKO75909 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNKO75909 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNKO75909 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNKO75909 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNKO75909 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNKO75909 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNKO75909 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNKO75909 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNKO75909 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNKO75909 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNKO75909 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNKO75909 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNKO75909 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNKO75909 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNKO75909 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNKO75909 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNKO75909 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNKO75909 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNKO75909 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNKO75909 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNKO75909 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNKO75909 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNKO75909 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNKO75909 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNKO75909 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNKO75909 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNKO75909 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNKO75909 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNKO75909 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNKO75909 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNKO75909 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNKO75909 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNKO75909 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNKO75909 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNKO75909 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNKO75909 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNKO75909 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNKO75909 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNKO75909 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNKO75909 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNKO75909 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNKO75909 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNKO75909 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNKO75909 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNKO75909 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNKO75909 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNKO75909 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNKO75909 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNKO75909 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNKO75909 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNKO75909 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNKO75909 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNKO75909 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNKO75909 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNKO75909 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNKO75909 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNKO75909 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNKO75909 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNKO75909 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNKO75909 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNKO75909 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNKO75909 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNKO75909 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNKO75909 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNKO75909 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNKO75909 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNKO75909 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNKO75909 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNKO75909 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNKO75909 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNKO75909 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNKO75909 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNKO75909 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms