Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATBO75879 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATBO75879 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATBO75879 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATBO75879 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATBO75879 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATBO75879 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATBO75879 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATBO75879 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATBO75879 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATBO75879 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATBO75879 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATBO75879 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GATBO75879 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATBO75879 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATBO75879 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATBO75879 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATBO75879 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATBO75879 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATBO75879 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATBO75879 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATBO75879 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATBO75879 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GATBO75879 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GATBO75879 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GATBO75879 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATBO75879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATBO75879 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATBO75879 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATBO75879 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATBO75879 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATBO75879 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GATBO75879 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATBO75879 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATBO75879 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATBO75879 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATBO75879 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATBO75879 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATBO75879 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATBO75879 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATBO75879 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GATBO75879 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATBO75879 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATBO75879 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATBO75879 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GATBO75879 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATBO75879 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATBO75879 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATBO75879 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATBO75879 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATBO75879 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATBO75879 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATBO75879 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATBO75879 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATBO75879 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATBO75879 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATBO75879 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATBO75879 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATBO75879 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATBO75879 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATBO75879 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATBO75879 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATBO75879 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATBO75879 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATBO75879 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATBO75879 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATBO75879 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATBO75879 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATBO75879 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATBO75879 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATBO75879 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATBO75879 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATBO75879 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATBO75879 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATBO75879 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATBO75879 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATBO75879 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATBO75879 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GATBO75879 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATBO75879 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATBO75879 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATBO75879 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATBO75879 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATBO75879 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATBO75879 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATBO75879 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATBO75879 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATBO75879 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATBO75879 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms