Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTP4A3O75365 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A3O75365 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTP4A3O75365 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTP4A3O75365 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms