Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP12O75317 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP12O75317 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP12O75317 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP12O75317 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP12O75317 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP12O75317 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP12O75317 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP12O75317 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP12O75317 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP12O75317 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP12O75317 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP12O75317 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP12O75317 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP12O75317 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP12O75317 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP12O75317 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP12O75317 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP12O75317 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP12O75317 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP12O75317 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP12O75317 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP12O75317 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP12O75317 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP12O75317 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP12O75317 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP12O75317 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP12O75317 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP12O75317 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP12O75317 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP12O75317 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP12O75317 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP12O75317 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP12O75317 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP12O75317 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP12O75317 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP12O75317 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP12O75317 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP12O75317 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP12O75317 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP12O75317 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP12O75317 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP12O75317 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP12O75317 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP12O75317 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP12O75317 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP12O75317 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP12O75317 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP12O75317 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP12O75317 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP12O75317 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP12O75317 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP12O75317 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP12O75317 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP12O75317 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP12O75317 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP12O75317 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP12O75317 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP12O75317 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP12O75317 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP12O75317 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP12O75317 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP12O75317 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP12O75317 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP12O75317 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP12O75317 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP12O75317 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP12O75317 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP12O75317 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP12O75317 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP12O75317 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP12O75317 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP12O75317 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP12O75317 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP12O75317 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP12O75317 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP12O75317 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP12O75317 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms