Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SS18L1O75177 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SS18L1O75177 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SS18L1O75177 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms