Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP2O75044 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP2O75044 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2O75044 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SRGAP2O75044 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2O75044 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2O75044 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2O75044 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2O75044 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2O75044 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2O75044 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2O75044 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2O75044 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2O75044 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2O75044 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2O75044 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2O75044 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2O75044 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2O75044 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2O75044 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2O75044 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP2O75044 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.8 ms