Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOL3O60936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOL3O60936 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOL3O60936 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOL3O60936 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOL3O60936 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOL3O60936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOL3O60936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOL3O60936 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOL3O60936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOL3O60936 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOL3O60936 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOL3O60936 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOL3O60936 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOL3O60936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOL3O60936 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOL3O60936 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NOL3O60936 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOL3O60936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOL3O60936 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOL3O60936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOL3O60936 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOL3O60936 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOL3O60936 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOL3O60936 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOL3O60936 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOL3O60936 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NOL3O60936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOL3O60936 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOL3O60936 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOL3O60936 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOL3O60936 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOL3O60936 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOL3O60936 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOL3O60936 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOL3O60936 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOL3O60936 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOL3O60936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NOL3O60936 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOL3O60936 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOL3O60936 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOL3O60936 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOL3O60936 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOL3O60936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOL3O60936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOL3O60936 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOL3O60936 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOL3O60936 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOL3O60936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOL3O60936 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOL3O60936 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOL3O60936 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOL3O60936 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOL3O60936 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOL3O60936 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOL3O60936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOL3O60936 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOL3O60936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NOL3O60936 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOL3O60936 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOL3O60936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOL3O60936 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOL3O60936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOL3O60936 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOL3O60936 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOL3O60936 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOL3O60936 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOL3O60936 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOL3O60936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOL3O60936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NOL3O60936 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOL3O60936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOL3O60936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOL3O60936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOL3O60936 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOL3O60936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOL3O60936 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOL3O60936 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOL3O60936 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms