Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LPXNO60711 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPXNO60711 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPXNO60711 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPXNO60711 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPXNO60711 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPXNO60711 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPXNO60711 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPXNO60711 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPXNO60711 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPXNO60711 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPXNO60711 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPXNO60711 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPXNO60711 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPXNO60711 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPXNO60711 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPXNO60711 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPXNO60711 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPXNO60711 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPXNO60711 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPXNO60711 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPXNO60711 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPXNO60711 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPXNO60711 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPXNO60711 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPXNO60711 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LPXNO60711 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LPXNO60711 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LPXNO60711 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LPXNO60711 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPXNO60711 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPXNO60711 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPXNO60711 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPXNO60711 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPXNO60711 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPXNO60711 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPXNO60711 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPXNO60711 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPXNO60711 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPXNO60711 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LPXNO60711 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LPXNO60711 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LPXNO60711 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPXNO60711 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPXNO60711 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPXNO60711 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPXNO60711 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPXNO60711 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LPXNO60711 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPXNO60711 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPXNO60711 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPXNO60711 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LPXNO60711 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LPXNO60711 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPXNO60711 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPXNO60711 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPXNO60711 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPXNO60711 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPXNO60711 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPXNO60711 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPXNO60711 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LPXNO60711 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPXNO60711 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPXNO60711 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPXNO60711 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPXNO60711 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LPXNO60711 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPXNO60711 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPXNO60711 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPXNO60711 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LPXNO60711 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPXNO60711 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPXNO60711 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LPXNO60711 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LPXNO60711 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPXNO60711 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPXNO60711 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPXNO60711 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPXNO60711 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPXNO60711 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LPXNO60711 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPXNO60711 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LPXNO60711 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPXNO60711 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPXNO60711 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPXNO60711 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPXNO60711 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPXNO60711 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPXNO60711 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPXNO60711 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPXNO60711 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPXNO60711 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPXNO60711 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPXNO60711 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LPXNO60711 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPXNO60711 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPXNO60711 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms