Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1AO60341 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM1AO60341 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM1AO60341 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM1AO60341 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1AO60341 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms