Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VEGFDO43915 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VEGFDO43915 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFDO43915 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFDO43915 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VEGFDO43915 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VEGFDO43915 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VEGFDO43915 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
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