Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCEO43556 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCEO43556 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCEO43556 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCEO43556 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCEO43556 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCEO43556 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCEO43556 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCEO43556 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCEO43556 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCEO43556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCEO43556 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCEO43556 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCEO43556 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCEO43556 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCEO43556 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCEO43556 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCEO43556 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCEO43556 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCEO43556 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCEO43556 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCEO43556 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCEO43556 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCEO43556 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCEO43556 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGCEO43556 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCEO43556 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCEO43556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCEO43556 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCEO43556 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCEO43556 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCEO43556 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCEO43556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCEO43556 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCEO43556 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCEO43556 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SGCEO43556 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCEO43556 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCEO43556 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCEO43556 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCEO43556 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCEO43556 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCEO43556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCEO43556 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCEO43556 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCEO43556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCEO43556 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCEO43556 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCEO43556 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCEO43556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCEO43556 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCEO43556 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCEO43556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCEO43556 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCEO43556 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCEO43556 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCEO43556 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCEO43556 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCEO43556 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCEO43556 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGCEO43556 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCEO43556 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCEO43556 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCEO43556 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGCEO43556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCEO43556 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCEO43556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCEO43556 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCEO43556 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCEO43556 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCEO43556 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCEO43556 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCEO43556 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCEO43556 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCEO43556 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCEO43556 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms