Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KCNQ2O43526 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNQ2O43526 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ2O43526 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ2O43526 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ2O43526 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ2O43526 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNQ2O43526 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms