Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPA12AO43301 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPA12AO43301 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA12AO43301 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA12AO43301 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA12AO43301 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms