Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1CO15160 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1CO15160 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1CO15160 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1CO15160 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms