Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNPHO15079 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNPHO15079 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNPHO15079 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNPHO15079 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNPHO15079 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNPHO15079 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNPHO15079 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNPHO15079 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNPHO15079 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNPHO15079 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNPHO15079 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNPHO15079 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNPHO15079 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNPHO15079 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms