Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCF2LO15068 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCF2LO15068 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCF2LO15068 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCF2LO15068 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCF2LO15068 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms