Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHOX2AO14813 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PHOX2AO14813 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHOX2AO14813 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PHOX2AO14813 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 675.8 ms