Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CUX2O14529 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
CUX2O14529 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CUX2O14529 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
CUX2O14529 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CUX2O14529 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CUX2O14529 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
CUX2O14529 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
CUX2O14529 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
CUX2O14529 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CUX2O14529 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CUX2O14529 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
CUX2O14529 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CUX2O14529 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
CUX2O14529 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.88■■■■■ 4.94
CUX2O14529 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CUX2O14529 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CUX2O14529 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
CUX2O14529 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
CUX2O14529 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
CUX2O14529 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CUX2O14529 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CUX2O14529 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CUX2O14529 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CUX2O14529 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CUX2O14529 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
CUX2O14529 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC45.76■■■■■ 4.92
CUX2O14529 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CUX2O14529 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CUX2O14529 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CUX2O14529 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CUX2O14529 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CUX2O14529 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
CUX2O14529 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CUX2O14529 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.91
CUX2O14529 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CUX2O14529 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CUX2O14529 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CUX2O14529 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CUX2O14529 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CUX2O14529 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CUX2O14529 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CUX2O14529 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
CUX2O14529 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
CUX2O14529 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
CUX2O14529 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CUX2O14529 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CUX2O14529 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
CUX2O14529 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CUX2O14529 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CUX2O14529 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CUX2O14529 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CUX2O14529 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CUX2O14529 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CUX2O14529 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CUX2O14529 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CUX2O14529 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CUX2O14529 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CUX2O14529 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CUX2O14529 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CUX2O14529 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CUX2O14529 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CUX2O14529 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CUX2O14529 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CUX2O14529 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.88
CUX2O14529 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CUX2O14529 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CUX2O14529 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CUX2O14529 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CUX2O14529 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CUX2O14529 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CUX2O14529 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CUX2O14529 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CUX2O14529 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CUX2O14529 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CUX2O14529 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CUX2O14529 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CUX2O14529 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CUX2O14529 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CUX2O14529 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
CUX2O14529 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CUX2O14529 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CUX2O14529 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CUX2O14529 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CUX2O14529 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CUX2O14529 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CUX2O14529 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CUX2O14529 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CUX2O14529 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CUX2O14529 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms