Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAP18O00422 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAP18O00422 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAP18O00422 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAP18O00422 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAP18O00422 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAP18O00422 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAP18O00422 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAP18O00422 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAP18O00422 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAP18O00422 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAP18O00422 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAP18O00422 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAP18O00422 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAP18O00422 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAP18O00422 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAP18O00422 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAP18O00422 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAP18O00422 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAP18O00422 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAP18O00422 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAP18O00422 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAP18O00422 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SAP18O00422 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAP18O00422 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAP18O00422 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAP18O00422 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAP18O00422 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAP18O00422 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAP18O00422 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAP18O00422 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAP18O00422 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAP18O00422 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAP18O00422 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAP18O00422 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAP18O00422 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAP18O00422 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAP18O00422 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAP18O00422 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAP18O00422 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAP18O00422 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAP18O00422 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAP18O00422 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP18O00422 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP18O00422 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP18O00422 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP18O00422 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAP18O00422 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAP18O00422 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP18O00422 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP18O00422 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP18O00422 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP18O00422 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP18O00422 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP18O00422 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP18O00422 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP18O00422 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP18O00422 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP18O00422 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP18O00422 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP18O00422 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP18O00422 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP18O00422 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP18O00422 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP18O00422 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP18O00422 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP18O00422 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP18O00422 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP18O00422 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP18O00422 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP18O00422 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP18O00422 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP18O00422 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP18O00422 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP18O00422 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP18O00422 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP18O00422 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP18O00422 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP18O00422 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP18O00422 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP18O00422 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAP18O00422 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAP18O00422 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAP18O00422 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms