Protein–RNA interactions for Protein: O00308

WWP2, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP2O00308 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WWP2O00308 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP2O00308 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP2O00308 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP2O00308 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WWP2O00308 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WWP2O00308 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WWP2O00308 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WWP2O00308 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP2O00308 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP2O00308 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WWP2O00308 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP2O00308 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP2O00308 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP2O00308 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WWP2O00308 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP2O00308 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP2O00308 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WWP2O00308 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP2O00308 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP2O00308 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WWP2O00308 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WWP2O00308 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WWP2O00308 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WWP2O00308 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WWP2O00308 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WWP2O00308 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP2O00308 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP2O00308 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP2O00308 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP2O00308 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WWP2O00308 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP2O00308 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP2O00308 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WWP2O00308 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WWP2O00308 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WWP2O00308 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP2O00308 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP2O00308 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WWP2O00308 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP2O00308 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP2O00308 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP2O00308 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WWP2O00308 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP2O00308 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP2O00308 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP2O00308 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WWP2O00308 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WWP2O00308 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WWP2O00308 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WWP2O00308 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WWP2O00308 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WWP2O00308 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WWP2O00308 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WWP2O00308 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WWP2O00308 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WWP2O00308 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WWP2O00308 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WWP2O00308 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WWP2O00308 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WWP2O00308 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WWP2O00308 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WWP2O00308 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WWP2O00308 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WWP2O00308 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WWP2O00308 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WWP2O00308 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WWP2O00308 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WWP2O00308 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WWP2O00308 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WWP2O00308 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WWP2O00308 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WWP2O00308 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WWP2O00308 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WWP2O00308 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WWP2O00308 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WWP2O00308 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WWP2O00308 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WWP2O00308 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WWP2O00308 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WWP2O00308 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WWP2O00308 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WWP2O00308 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WWP2O00308 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WWP2O00308 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WWP2O00308 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms