Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN34H7C241 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN34H7C241 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLDN34H7C241 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN34H7C241 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN34H7C241 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN34H7C241 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN34H7C241 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN34H7C241 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN34H7C241 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN34H7C241 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN34H7C241 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN34H7C241 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN34H7C241 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN34H7C241 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN34H7C241 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN34H7C241 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN34H7C241 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN34H7C241 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN34H7C241 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN34H7C241 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN34H7C241 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN34H7C241 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms