Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf172C9J069 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf172C9J069 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf172C9J069 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf172C9J069 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf172C9J069 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf172C9J069 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf172C9J069 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf172C9J069 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf172C9J069 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf172C9J069 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf172C9J069 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf172C9J069 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf172C9J069 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf172C9J069 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms