Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSTM5A8MXK1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSTM5A8MXK1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM5A8MXK1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM5A8MXK1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms