Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOTOA8MTQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOTOA8MTQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOTOA8MTQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NOTOA8MTQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms