Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD8B2A6NJW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8B2A6NJW9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8B2A6NJW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8B2A6NJW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms