Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC160A6NGH7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC160A6NGH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC160A6NGH7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC160A6NGH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC160A6NGH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC160A6NGH7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms