Protein–RNA interactions for Protein: A6NG13

MGAT4D, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein MGAT4D, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4DA6NG13 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MGAT4DA6NG13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MGAT4DA6NG13 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MGAT4DA6NG13 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGAT4DA6NG13 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms