Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms