Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMX2A2RU54 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMX2A2RU54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMX2A2RU54 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMX2A2RU54 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms