Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC2LA1A4F0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PQLC2LA1A4F0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PQLC2LA1A4F0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PQLC2LA1A4F0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PQLC2LA1A4F0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PQLC2LA1A4F0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PQLC2LA1A4F0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms