Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQY0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
A0A1W2PQY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PQY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PQY0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A1W2PQY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A1W2PQY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A1W2PQY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
A0A1W2PQY0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1W2PQY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1W2PQY0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
A0A1W2PQY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms