Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A1W2PQD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A1W2PQD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A1W2PQD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A1W2PQD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A1W2PQD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PQD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A1W2PQD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms