Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PPL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PPL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1W2PPL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms