Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A1W2PPC1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
A0A1W2PPC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A1W2PPC1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A1W2PPC1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
A0A1W2PPC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A1W2PPC1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1W2PPC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms